Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms