Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK8P49336 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms