Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLD1P28340 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLD1P28340 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms