Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms