Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms