Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms