Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TTC30A-201ENST00000355689 5975 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA6-201ENST00000272203 7401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms