Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms