Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PTPRJQ12913 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PTPRJQ12913 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PTPRJQ12913 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRJQ12913 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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