Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LMAN1P49257 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms