Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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