Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms