Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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SGCZQ96LD1 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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SGCZQ96LD1 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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SGCZQ96LD1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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