Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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