Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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