Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 DPPA5P4-201ENST00000559021 365 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 AKR1B1P7-201ENST00000587229 952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 AC092327.1-201ENST00000596612 744 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 PRSS2-205ENST00000632998 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NESP48681 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 PLP2-201ENST00000376322 620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 AL589843.2-201ENST00000445872 1262 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 AL592463.1-201ENST00000451108 635 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 HPR-203ENST00000561690 634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 AC134312.5-202ENST00000562705 756 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 ACAP1-204ENST00000570504 274 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 AC011472.2-201ENST00000586356 655 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 CCDC89-201ENST00000316398 1412 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NESP48681 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AL096677.1-201ENST00000442884 814 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AL353807.2-201ENST00000456382 220 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AC106774.3-201ENST00000505444 169 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 APOC1P1-202ENST00000571466 253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AC006111.1-201ENST00000573982 329 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AC100830.3-201ENST00000583044 554 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AC239859.5-201ENST00000614100 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 CHIAP2-204ENST00000532686 1449 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AL590552.1-201ENST00000623164 1770 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 SNORA9B-201ENST00000384170 133 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 TRAV38-2DV8-201ENST00000390465 395 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 LINC00879-202ENST00000463200 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 MPHOSPH6-203ENST00000563504 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 LINC00663-207ENST00000590092 1023 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AC007032.1-201ENST00000609281 847 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NESP48681 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 AC005037.1-202ENST00000332935 820 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 SMN1-202ENST00000380707 1536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 SMN2-203ENST00000380743 1536 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 C17orf75-202ENST00000577809 1642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NESP48681 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 MYF5-201ENST00000228644 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 NTF3-201ENST00000331010 1028 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 AC092966.1-201ENST00000414895 526 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms