Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LINC01159-201ENST00000433433 3103 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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CTRB1P17538 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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CTRB1P17538 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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CTRB1P17538 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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CTRB1P17538 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 DNAJB5-210ENST00000545841 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CDHR4-202ENST00000412678 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FCRL2-201ENST00000361516 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 DERL1-201ENST00000259512 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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