Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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