Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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TMEM225BP0DP42 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TMEM225BP0DP42 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TMEM225BP0DP42 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TMEM225BP0DP42 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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TMEM225BP0DP42 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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TMEM225BP0DP42 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TMEM225BP0DP42 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TMEM225BP0DP42 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TMEM225BP0DP42 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TMEM225BP0DP42 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TMEM225BP0DP42 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TMEM225BP0DP42 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TMEM225BP0DP42 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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