Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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