Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms