Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms