Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF397Q8NF99 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms