Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms