Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms