Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms