Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms