Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms