Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP1P78357 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CNTNAP1P78357 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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