Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SH3BP2P78314 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2P78314 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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