Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms