Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms