Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SCN2BO60939 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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