Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 IGHV3-60-201ENST00000521678 354 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P69-201ENST00000552536 933 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PRKN-210ENST00000612540 603 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MYL2-201ENST00000228841 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PRSS3-203ENST00000379405 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TRBV22-1-201ENST00000424543 337 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 OR10V2P-201ENST00000525296 764 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AL512631.1-201ENST00000604086 840 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MAS1LP1-206ENST00000419416 1047 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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