Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms