Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms