Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms