Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB3P54284 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms