Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms