Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPOP42166 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPOP42166 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMPOP42166 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms