Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBP2P32456 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBP2P32456 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP2P32456 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP2P32456 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP2P32456 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms