Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFNP31947 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms