Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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