Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ICA1L-222ENST00000617388 8151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CTTNBP2-201ENST00000160373 5970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms