Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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