Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms