Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRJQ12913 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRJQ12913 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRJQ12913 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRJQ12913 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRJQ12913 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRJQ12913 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRJQ12913 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PTPRJQ12913 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PTPRJQ12913 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PTPRJQ12913 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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