Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms