Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms