Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC007557.2-201ENST00000440900 583 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 FAM83A-AS1-201ENST00000517519 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC140658.2-201ENST00000566360 348 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 CASC15-202ENST00000561912 1449 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRXP46100 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRXP46100 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRXP46100 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRXP46100 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 RPL18P1-201ENST00000497218 552 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC015909.2-201ENST00000523083 547 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TRIQK-213ENST00000521617 774 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC007032.1-201ENST00000609281 847 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 IQCD-201ENST00000299732 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRXP46100 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 RARRES3-202ENST00000354445 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SPATA8-AS1-202ENST00000560888 392 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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